| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Ábel Márton Milán (2005)Budaörsi Sport Club | 00:25.85R:0.61 | - | 529 | |
| 2 | 3 | Herman Szabó Péter (2007)Győri Úszó Sportegy. | 00:26.28R:0.67 | 00:00.43 | 503 | |
| 3 | 5 | Matyó Márton (2004)Bálinti Úszó Egyes. | 00:26.30R:0.69 | 00:00.45 | 502 | |
| 4 | 9 | Gulyás Csaba (2007)Parafa Úszó Klub | 00:26.47R:0.64 | 00:00.62 | 492 | |
| 5 | 6 | Bánsági Balázs (2005)Stamina TKSA | 00:26.50R:0.16 | 00:00.65 | 491 | |
| 6 | 7 | Szántosi Tamás (2005)Bajai SSC | 00:26.83R:0.69 | 00:00.98 | 473 | |
| 7 | 2 | Rákosfalvy Zalán (2004)Győri Úszó Sportegy. | 00:26.86R:0.67 | 00:01.01 | 471 | |
| 8 | 8 | Sárközi Szabolcs (2007)Kaposvári SI | 00:26.89R:0.66 | 00:01.04 | 470 | |
| 9 | 1 | Sztrehárszky Zsigmond (2008)Budapesti Honvéd | 00:26.90R:0.64 | 00:01.05 | 469 | |
| 10 | 0 | Lajkó Csanád (2004)Szhalombattai VUK SE | 00:27.17R:0.63 | 00:01.32 | 455 |