| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 8 | Kammerer Erick André (2012)Tiszakécskei Vízisport Klub | 40.32R:0.86 | - | 139 | |
| 2 | 3 | Bojó Botond (2015)Érdi Vízisport Kft | 40.99R:0.66 | 00.67 | 132 | |
| 3 | 7 | Váradi Dániel (2017)Darnyi Tamás SC | 41.36R:0.52 | 01.04 | 129 | |
| 4 | 2 | Varga Márton Patrik (2016)Budapesti Honvéd SE | 42.00 | 01.68 | 123 | |
| 5 | 4 | Győrffy Kende (2015)II. Kerületi Sport | 43.26R:0.65 | 02.94 | 112 | |
| 6 | 6 | Katona Zétény (2016)Ferencvárosi Torna Club | 44.24 | 03.92 | 105 | |
| 7 | 1 | Kalaus Vilmos Leo (2016)Bohóchal | 44.60 | 04.28 | 103 | |
| 8 | 9 | Molnár-Szalai András Béla (2015)Budapesti Honvéd SE | 46.74 | 06.42 | 89 | |
| 9 | 5 | Kardos Benedek Vid (2016)II. Kerületi Sport | 47.17R:0.71 | 06.85 | 87 | |
| - | 0 | Pál Flórián (2016)Kis-Pingvin SE | DNS |