| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Nagy Bendegúz (2012)Bohóchal | 41.53R:0.67 | - | 243 | |
| 2 | 4 | Dmitrenko Nikita (2015)Bohóchal | 44.84R:0.67 | 03.31 | 193 | |
| 3 | 7 | Moldvai Dániel Ádám (2011)Bohóchal | 46.51R:0.52 | 04.98 | 173 | |
| 4 | 6 | Grizner Árpád Áron (2014)DKSE Dunaújváros | 47.26R:0.78 | 05.73 | 165 | |
| 5 | 2 | Méhes Márk (2015)Váci Vízmű SE | 47.91R:0.8 | 06.38 | 158 | |
| 6 | 3 | Höflinger Dániel (2013)Hullám 91 | 48.08R:0.82 | 06.55 | 157 | |
| 7 | 1 | Petőfi Bulcsú (2015)Tiszakécskei Vízisport Klub | 49.58R:0.73 | 08.05 | 143 | |
| 8 | 8 | Vesztergom Dániel (2014)Darnyi Tamás SC | 49.87 | 08.34 | 140 | |
| 9 | 9 | Szalai Marcell (2014)Ferencvárosi Torna Club | 51.77R:0.5 | 10.24 | 125 | |
| 10 | 0 | Tordai Dániel (2017)Kőbánya Sport Club | 52.73R:0.76 | 11.20 | 119 |