| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Dobák Milán Kolen (2014)A Jövő SC | 49.48R:0.69 | - | 110 | |
| 2 | 5 | Omai Barnabás (2014)Budaörsi Sport Club | 49.96R:0.69 | 00.48 | 106 | |
| 3 | 3 | Emmer Ábris (2014)II. Kerületi Sport | 51.82R:0.7 | 02.34 | 95 | |
| 4 | 2 | Kulcsár Benedek (2015)II. Kerületi Sport | 54.37R:0.84 | 04.89 | 82 | |
| 5 | 8 | Szederkényi Máté (2015)II. Kerületi Sport | 55.81R:0.51 | 06.33 | 76 | |
| 6 | 6 | Széll Péter (2014)II. Kerületi Sport | 58.26R:0.43 | 08.78 | 67 | |
| 7 | 7 | Stettler Péter (2015)Hullám 91 | 58.55R:0.5 | 09.07 | 66 | |
| 8 | 1 | Jónás Erik (2013)Mozduljunk Együtt Sport Egyesület | 59.59R:0.67 | 10.11 | 62 | |
| 9 | 0 | Kardos Benedek Vid (2016)II. Kerületi Sport | 01:00.75R:0.98 | 11.27 | 59 | |
| 10 | 9 | Szavéri Patrik (2015)Kőbánya Sport Club | 01:11.60R:0.75 | 22.12 | 36 |