| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | Vinkovics Márton (2013)Soproni Széchy T. SI | 45.33R:0.82 | - | 143 | |
| 2 | 4 | Laczkó Olivér (2014)Kőbánya Sport Club | 45.89R:0.66 | 00.56 | 137 | |
| 3 | 3 | Babarczi Alfréd (2014)Bohóchal Egyesület | 46.50R:0.62 | 01.17 | 132 | |
| 4 | 7 | Balla Zalán Benedek (2015)Szhalombattai VUK SE | 47.50R:0.58 | 02.17 | 124 | |
| 5 | 6 | Fekete Tamás Áron (2015)Komáromi Úszóklub SE | 48.43R:0.68 | 03.10 | 117 | |
| 6 | 5 | Csabai Imre (2013)A Jövő SC | 48.53R:0.8 | 03.20 | 116 | |
| 7 | 8 | Kiss-Kovács Gellért (2014)II. Kerületi Sport | 48.62R:0.73 | 03.29 | 115 | |
| 8 | 0 | Dege Marcell (2012)MATE - GEAC | 49.39R:0.57 | 04.06 | 110 | |
| 9 | 9 | Takács György Martin (2014)Kőbánya Sport Club | 50.73R:0.71 | 05.40 | 102 | |
| 10 | 2 | Nagy-Varga Mátyás (2012)Hatvani Úszó Klub SE | 51.90R:0.78 | 06.57 | 95 |