| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Hauptmann Márton (2012)Győri Úszó Sportegy. | 40.06R:0.59 | - | 207 | |
| 2 | 8 | Petrovics Róbert (2012)Hatvani Úszó Klub SE | 41.14R:0.67 | 01.08 | 191 | |
| 3 | 4 | Sáry Hunor (2013)Kőbánya Sport Club | 41.21R:0.78 | 01.15 | 190 | |
| 4 | 1 | Timár Benjamin Sean (2014)Szhalombattai VUK SE | 43.07R:0.56 | 03.01 | 166 | |
| 5 | 9 | Bartolák Botond (2013)Monori Sport Egyes. | 43.18R:0.46 | 03.12 | 165 | |
| 6 | 7 | Moldvai Dániel Ádám (2011)Bohóchal Egyesület | 43.37R:0.71 | 03.31 | 163 | |
| 7 | 0 | Bálint Gergő (2014)Monori Sport Egyes. | 44.32R:0.52 | 04.26 | 153 | |
| 8 | 2 | Ebinger Zsombor (2015)Kőbánya Sport Club | 44.33R:0.67 | 04.27 | 153 | |
| 9 | 6 | Chernobrovkin Nikolay (2012)Ybl Waterpolo Club | 45.11R:0.56 | 05.05 | 145 | |
| 10 | 3 | Száraz Vince (2012)Városi Sportegyesület Dunakeszi | 45.50R:0.62 | 05.44 | 141 |