| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Németh Boldizsár (2012)Hullám 91 | 51.13R:0.75 | - | 130 | |
| 2 | 4 | Szabadházi András (2013)Bohóchal Egyesület | 51.48 | 00.35 | 128 | |
| 3 | 6 | Létang-Prónay Martin (2015)Kőbánya Sport Club | 52.78 | 01.65 | 118 | |
| 4 | 3 | Bőhm Ignác András (2012)Bohóchal Egyesület | 52.85R:0.63 | 01.72 | 118 | |
| 5 | 1 | Ebinger Zsombor (2015)Kőbánya Sport Club | 53.21 | 02.08 | 115 | |
| 6 | 8 | Balogh-Fazekas Ákos (2013)Hullám 91 | 55.12R:0.85 | 03.99 | 104 | |
| 7 | 7 | Csajági Dániel (2014)Iron Swim SE | 55.25R:0.57 | 04.12 | 103 | |
| 8 | 0 | Varga Bernát (2012)Budafóka XXII. SE | 56.21R:0.88 | 05.08 | 98 | |
| 9 | 2 | Simonyi Bendegúz (2013)Váci Ifjúsági SE | 56.47R:0.87 | 05.34 | 97 | |
| 10 | 9 | Süvegh Kende Barnabás (2012)Hullám 91 | 58.35 | 07.22 | 87 |