| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | Vig Dominik Bence (2011)Csepeli Öttusa Vizis | 42.35 | - | 120 | |
| 2 | 9 | Fűtő Zsombor (2014)Kőbánya Sport Club | 42.61 | 00.26 | 118 | |
| 3 | 4 | Simonyi Bendegúz (2013)Váci Ifjúsági SE | 42.72 | 00.37 | 117 | |
| 4 | 5 | Molnár Erik Lehel (2015)FTC | 43.85 | 01.50 | 108 | |
| 5 | 1 | Legény Bence (2015)Kőbánya Sport Club | 45.14 | 02.79 | 99 | |
| 6 | 3 | Fehér Illés (2015)Gigászok SE | 45.77 | 03.42 | 95 | |
| 7 | 6 | Gyuricza Zsombor (2014)Budapesti Honvéd | 46.64R:0.44 | 04.29 | 90 | |
| 7 | 7 | Balogh-Fazekas Ákos (2013)Hullám 91 | 46.64 | 04.29 | 90 | |
| 9 | 0 | Dobák Milán Kolen (2014)A Jövő SC | 47.12R:0.93 | 04.77 | 87 | |
| 10 | 8 | Zsivin László Lajos (2013)Hullám 91 | 49.86R:0.73 | 07.51 | 73 |