| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3 | Balogh Bence Zsolt (2009)Monori Sport Egyes. | 28.46R:0.65 | - | 396 | |
| 2 | 6 | Varga Áron Dániel (2008)Budapesti Honvéd | 28.48R:0.64 | 00.02 | 395 | |
| 3 | 5 | Csatári Nimród Bence (2009)BÁCSVÍZ SC | 28.52R:0.77 | 00.06 | 394 | |
| 4 | 7 | Sudár Balázs (2009)Budafóka XXII. SE | 28.53R:0.68 | 00.07 | 393 | |
| 5 | 8 | Váradi Márton (2009)FTC | 28.78R:0.67 | 00.32 | 383 | |
| 6 | 4 | Nagy Kristóf (2009)Győri Úszó Sportegy. | 28.86R:0.74 | 00.40 | 380 | |
| 7 | 0 | Márton Levente (2010)FTC | 28.92R:0.75 | 00.46 | 377 | |
| 8 | 1 | Kovács Tamás János (2008)BÁCSVÍZ SC | 29.04R:0.67 | 00.58 | 373 | |
| 9 | 2 | Gál Barna Rudolf (2009)Monori Sport Egyes. | 29.48R:0.68 | 01.02 | 356 | |
| 10 | 9 | Szalontai Roland (2009)BÁCSVÍZ SC | 30.06R:0.51 | 01.60 | 336 |