| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Kárpáti Kende (2007)Miskolci Sportiskola | 00:33.14R:0.67 | - | 480 | |
| 2 | 6 | Szabó Gergő (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 00:34.46R:0.78 | 00:01.32 | 427 | |
| 3 | 3 | König Ábel (2007)Mohácsi Torna Egylet | 00:34.60R:0.66 | 00:01.46 | 421 | |
| 4 | 9 | Sárosi Csongor (2007)Darnyi Tamás SC | 00:34.76R:0.72 | 00:01.62 | 416 | |
| 5 | 5 | László Dávid (2007)Kiskunhalasi ÚGYE | 00:34.98R:0.69 | 00:01.84 | 408 | |
| 6 | 1 | Németh Lázár (2006)Miskolci Sportiskola | 00:35.41R:0.64 | 00:02.27 | 393 | |
| 7 | 0 | Kovencz Áron (2007)Kaposvári "Adorján" | 00:35.62R:0.65 | 00:02.48 | 386 | |
| 8 | 7 | Szabó Norbert (2007)Délzalai Vízmű SE | 00:35.70R:0.66 | 00:02.56 | 384 | |
| 9 | 8 | Takács Nimród (2007)A Jövő SC | 00:35.85R:0.72 | 00:02.71 | 379 | |
| - | 2 | Mile Dániel (2006)Körös Ú | DNS |