| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Kulcsár Barnabás (2007)Sárvári Gyógyfürdő | 00:25.51R:0.69 | - | 550 | |
| 2 | 6 | Mező Szabolcs (2007)Debreceni Sportc. SI | 00:26.56R:0.59 | 00:01.05 | 487 | |
| 3 | 0 | Szabácsik Máté (2007)Budapesti Honvéd | 00:26.62R:0.68 | 00:01.11 | 484 | |
| 4 | 5 | Gulyás Csaba (2007)Parafa Úszó Klub | 00:26.69R:0.69 | 00:01.18 | 480 | |
| 5 | 8 | Kovács Ferenc (2006)FTC | 00:26.83R:0.65 | 00:01.32 | 473 | |
| 6 | 7 | Li Chenxu (2007)Soproni Széchy T. SI | 00:26.90R:0.63 | 00:01.39 | 469 | |
| 7 | 3 | Sárközi Szabolcs (2007)Kaposvári SI | 00:27.09R:0.67 | 00:01.58 | 459 | |
| 8 | 9 | Mentes Domonkos (2007)Soproni Széchy T. SI | 00:27.51R:0.64 | 00:02.00 | 439 | |
| - | 1 | Prépost Ádám (2006)Győri Úszó Sportegy. | DNS | |||
| - | 2 | Pápai Olivér (2009)Győri Úszó Sportegy. | DNS |