| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | Bukovics Bendegúz Alex (2013)Darnyi Tamás SC | 40.88 | - | 133 | |
| 2 | 5 | Szalkai Péter Bálint (2012)Kőbánya Sport Club | 41.93 | 01.05 | 124 | |
| 3 | 8 | Tóth Benjámin Gergő (2011)Érdi Vízisport Kft | 42.31 | 01.43 | 120 | |
| 4 | 3 | Fajcsák Bálint (2013)Budapesti Honvéd | 42.34 | 01.46 | 120 | |
| 5 | 4 | Benke Richárd (2013)Bohóchal Egyesület | 42.99 | 02.11 | 115 | |
| 6 | 7 | Gál Levente András (2012)BVSC-Zugló | 44.45 | 03.57 | 104 | |
| 7 | 6 | Hollósi Zalán (2012)Bohóchal Egyesület | 44.79 | 03.91 | 101 | |
| 8 | 2 | Juhász Dávid (2013)Kis-Pingvin SE | 44.88 | 04.00 | 101 |