| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3 | Bene Zsombor (2004)Vasas Sport Club | 33.90R:0.62 | - | 448 | |
| 2 | 5 | Plumpton Milán (2008)Bohóchal Egyesület | 34.20R:0.54 | 00.30 | 436 | |
| 3 | 6 | Tóth Dániel (2007)Iron Swim SE | 34.29R:0.69 | 00.39 | 433 | |
| 4 | 7 | Fónyi Pintér Iván (2008)Kőbánya Sport Club | 36.19R:0.54 | 02.29 | 368 | |
| 5 | 2 | Sárosi Csongor (2007)Darnyi Tamás SC | 36.30R:0.7 | 02.40 | 365 | |
| 6 | 8 | Szabó Kiss Zétény (2007)Móri Úszó Egyesület | 36.78R:0.69 | 02.88 | 351 | |
| 7 | 1 | Rohonczi Zalán (2008)MÚSZ | 36.97R:0.61 | 03.07 | 345 | |
| 8 | 0 | Klinda Tamás (2008)Váci Ifjúsági SE | 37.02R:0.69 | 03.12 | 344 | |
| 9 | 9 | Horváth Frank Szilveszter (2009)A Jövő SC | 38.79R:0.67 | 04.89 | 299 | |
| - | 4 | M.Kiss Jakab (2005)Vasas Sport Club | DNS |