| RK | Name | H/L | Time | Gap | Q |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Loze Iaroslav (2007)Russian Federation | 04:29.73 94.920% | - | D4 | |
| 2 | Zanyi Ferdinánd Tamás (2007)Lőrinc Swim Team | 04:36.00 96.490% | 06.27 | D5 | |
| 3 | Kovács Botond (2007)BVSC-Zugló | 04:37.83 95.158% | 08.10 | D3 | |
| 4 | Poteczin Dániel (2006)Érdi Vízisport Kft | 04:39.05 99.651% | 09.32 | D6 | |
| 5 | Kárpáti Máté (2008)Újpesti Torna Egylet | 04:39.72 97.399% | 09.99 | D2 | |
| 6 | Buda Levente (2008)UNI Győri Úszó Sportegy. | 04:39.89 98.218% | 10.16 | D7 | |
| 7 | Sárközi Szabolcs (2007)Kaposvári Sportközpont és Sportiskola | 04:43.41 98.532% | 13.68 | D1 | |
| 8 | Nagy Bence (2007)Újpesti Torna Egylet | 04:45.49 100.920% | 15.76 | D8 | |
| 9 | Szabó Gergő (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 04:45.85 100.052% | 16.12 | T1 | |
| 10 | Páva Szabolcs (2006)A Jövő SC | 04:47.80 102.328% | 18.07 | T2 | |
| 11 | Vörös Zsombor (2007)UNI Győri Úszó Sportegy. | 04:52.86 99.850% | 23.13 | ||
| 12 | Honti-Pecora Sebestyén (2007)Újpesti Torna Egylet | 04:59.06 96.174% | 29.33 | ||
| 13 | Juhász Soma Andor (2008)Budapesti Honvéd SE | 05:09.00 97.499% | 39.27 | ||