| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 7 | Méhes Márk (2015)Váci Vízmű SE | 50.20R:0.6 | - | 138 | |
| 2 | 4 | Bőhm Ignác András (2012)Bohóchal Egyesület | 50.88 | 00.68 | 132 | |
| 3 | 6 | Dmitrenko Nikita (2015)Bohóchal Egyesület | 52.07 | 01.87 | 123 | |
| 4 | 5 | Bukovics Bendegúz Alex (2013)Budapesti Honvéd | 52.60 | 02.40 | 120 | |
| 5 | 3 | Szűcs Milán (2011)Budapesti Honvéd | 52.73R:0.73 | 02.53 | 119 | |
| 6 | 1 | Legény Bence (2015)Kőbánya Sport Club | 54.11 | 03.91 | 110 | |
| 7 | 2 | Csajági Dániel (2014)Iron Swim SE | 54.18R:0.72 | 03.98 | 109 | |
| 8 | 9 | Nanseu Marc Emmanuel (2011)Budapesti Honvéd | 54.79R:0.88 | 04.59 | 106 | |
| 9 | 8 | Könnyű Merse Barnabás (2013)MATE - GEAC | 55.08 | 04.88 | 104 | |
| - | 0 | Dobák Milán Kolen (2014)A Jövő SC | DSQ |