| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Benke Richárd (2013)Bohóchal Egyesület | 40.55R:-0.25 | - | 199 | |
| 2 | 1 | Dobján Krisztián (2013)DELFIN SE | 42.90R:0.56 | 02.35 | 168 | |
| 3 | 5 | Ebinger Zsombor (2015)Kőbánya Sport Club | 43.26R:0.45 | 02.71 | 164 | |
| 4 | 7 | Barta Ákos (2013)Budapesti Honvéd | 46.20R:0.84 | 05.65 | 135 | |
| 5 | 2 | Tófalvi Balázs Nándor (2013)Kőbánya Sport Club | 46.85R:0.65 | 06.30 | 129 | |
| 6 | 6 | Szilágyi Dániel (2013)Budapesti Honvéd | 47.15R:0.7 | 06.60 | 127 | |
| 7 | 3 | Nyári Hunor (2013)Budaörsi Sport Club | 47.47R:0.7 | 06.92 | 124 | |
| 8 | 8 | Babarczi Alfréd (2014)Bohóchal Egyesület | 48.98R:0.6 | 08.43 | 113 | |
| 9 | 0 | Szabadházi András (2013)Bohóchal Egyesület | 49.81R:0.68 | 09.26 | 107 | |
| 10 | 9 | Legény Bence (2015)Kőbánya Sport Club | 51.62R:0.91 | 11.07 | 96 |