| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Orentsák Lóránt (2012)Bohóchal Egyesület | 41.94 | - | 236 | |
| 2 | 5 | Varga Ágoston (2012)Budapesti Honvéd | 42.11 | 00.17 | 234 | |
| 3 | 3 | Jancsa Hetény (2012)Budapesti Honvéd | 43.35 | 01.41 | 214 | |
| 4 | 6 | Hürkecz Gergő (2012)Kőbánya Sport Club | 44.09 | 02.15 | 203 | |
| 5 | 7 | Chernobrovkin Nikolay (2012)Ybl Waterpolo Club | 44.50 | 02.56 | 198 | |
| 6 | 2 | Rotár Oscar (2013)BVSC-Zugló | 47.47 | 05.53 | 163 | |
| 7 | 8 | Nagy Bendegúz (2012)Bohóchal Egyesület | 47.60 | 05.66 | 162 | |
| - | 1 | Hajós Dániel (2012)II. Kerületi Sport | VL |