| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Vincze Martin (2012)Debreceni Sportc. SI | 00:46.37 | - | 175 | |
| 2 | 5 | Juhász Kristóf (2010)Váci Ifjúsági SE | 00:49.62R:0.88 | 00:03.25 | 143 | |
| 3 | 6 | Rácz Patrik (2008)Mozgásjavító Diák Sport Egyesület | 00:53.99R:0.94 | 00:07.62 | 111 | |
| 4 | 2 | Kiss Benjámin (2015)Debreceni Sportc. SI | 01:04.95 | 00:18.58 | 63 | |
| 5 | 7 | Zavaczki Lóránt (2015)Debreceni Sportc. SI | 01:08.30 | 00:21.93 | 54 | |
| 6 | 8 | Czettner Csongor (2016)Kisteleki Úszó Egyesület | 01:10.78 | 00:24.41 | 49 | |
| 7 | 9 | Berettyán Dániel (2014)Debreceni Sportc. SI | 01:28.66R:0.47 | 00:42.29 | 25 | |
| 8 | 0 | Téglási András Attila (2016)Egyéni | 01:29.48 | 00:43.11 | 24 | |
| 9 | 1 | Török Bence (2012)Mozgásjavító Diák Sport Egyesület | 01:33.69 | 00:47.32 | 21 | |
| - | 3 | Földi Levente (2010)Mozgásjavító Diák Sport Egyesület | DNS |