| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Varga Ágoston (2012)Budapesti Honvéd | 40.86 | - | 256 | |
| 2 | 1 | Rotár Oscar (2013)BVSC-Zugló | 42.24 | 01.38 | 231 | |
| 3 | 6 | Zirner Dávid (2012)H2O Sportegyesület | 42.58 | 01.72 | 226 | |
| 4 | 7 | Váradi András (2013)BVSC-Zugló | 43.15 | 02.29 | 217 | |
| 5 | 8 | Kuna Márk Károly (2013)BVSC-Zugló | 43.24 | 02.38 | 216 | |
| 6 | 5 | Tóth Marcell (2012)Miskolci Sportiskola | 43.63 | 02.77 | 210 | |
| 7 | 2 | Czipó Bence József (2013)Miskolci Sportiskola | 43.66 | 02.80 | 209 | |
| 8 | 3 | Dudás Vilmos (2013)Érdi Vízisport Kft | 44.19 | 03.33 | 202 |