| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Sámóczi Milán (2005)Kőbánya Sport Club | 28.20R:0.67 | - | 692 | |
| 2 | 1 | Adorján Kende (2006)Szegedi Úszó Egylet | 28.21R:0.68 | 00.01 | 691 | |
| 3 | 5 | Eszes János Márk (2006)Újpesti Torna Egylet | 28.27R:0.64 | 00.07 | 687 | |
| 4 | 6 | Koós Márton Balázs (2005)UNI Győri Úszó Sportegy. | 28.52R:0.63 | 00.32 | 669 | |
| 5 | 3 | Józsa Ádám (2005)BVSC-Zugló | 28.93R:0.71 | 00.73 | 641 | |
| 6 | 2 | Csorvási Dominik (2005)Vasas Sport Club | 29.08R:0.58 | 00.88 | 631 | |
| 7 | 7 | Barkóczi Roland (2006)Nyiregyházi Sportc.Nonprofit.Kft. | 29.29R:0.68 | 01.09 | 618 | |
| 8 | 8 | Kanfi-Horváth Levente (2006)HÓD Úszó SE | 29.76R:0.64 | 01.56 | 589 |