| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Bóna Benedek (2004)BVSC-Zugló | 52.28 | - | 720 | |
| 2 | 5 | Hosszú Máté (2006)UNI Győri Úszó Sportegy. | 52.52 | 00.24 | 710 | |
| 3 | 3 | Kulcsár Barnabás (2007)UNI Győri Úszó Sportegy. | 54.63 | 02.35 | 631 | |
| 4 | 7 | Eitler Péter Patrik (2008)Debreceni Sportc. SI | 55.79 | 03.51 | 592 | |
| 5 | 6 | Vonyik András (2005)UNI Győri Úszó Sportegy. | 55.94 | 03.66 | 587 | |
| 6 | 8 | Kenyeres Gergő (2008)Debreceni Sportc. SI | 56.38 | 04.10 | 574 | |
| 7 | 1 | Koncz Márton (2008)Budaörsi Sport Club | 58.52 | 06.24 | 513 | |
| - | 2 | Szappanos Kristóf (2007)Budaörsi Sport Club | DNS |