| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Doszpoly Zsombor (2008)Miskolci Sportiskola | 53.15 | - | 685 | |
| 2 | 5 | Takács Milán Ruben (2008)UNI Győri Úszó Sportegy. | 54.55 | 01.40 | 633 | |
| 3 | 3 | Kreisz Bálint (2009)Bohóchal | 55.07 | 01.92 | 616 | |
| 4 | 6 | Csekő Dominik (2008)UNI Győri Úszó Sportegy. | 55.59 | 02.44 | 598 | |
| 5 | 7 | Ozsvárt Gábor (2009)Parafa Úszó Klub | 55.65 | 02.50 | 597 | |
| 6 | 8 | Csaba György (2008)BVSC-Zugló | 55.75 | 02.60 | 593 | |
| 7 | 1 | Koroncai Mátyás (2008)BVSC-Zugló | 56.05 | 02.90 | 584 | |
| 8 | 2 | Eitler Péter Patrik (2008)Debreceni Sportc. SI | 56.80 | 03.65 | 561 |