| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Nell Olivér (2003)Stamina TKSA | 50.85 | - | 782 | |
| 2 | 3 | Kovács Attila (2004)Egri Úszó Klub SE | 51.11 | 00.26 | 770 | |
| 3 | 5 | Bóna Benedek (2004)BVSC-Zugló | 51.23 | 00.38 | 765 | |
| 4 | 2 | Kormos Kristóf (2004)Egri Úszó Klub SE | 54.14 | 03.29 | 648 | |
| 5 | 6 | Bánsági Balázs (2005)Stamina TKSA | 54.44 | 03.59 | 637 | |
| 6 | 7 | Györe Ádám (2004)Egri Úszó Klub SE | 54.73 | 03.88 | 627 | |
| 7 | 1 | Vonyik András (2005)UNI Győri Úszó Sportegy. | 55.11 | 04.26 | 614 | |
| 8 | 8 | Török Gergely (2003)Egri Úszó Klub SE | 57.29 | 06.44 | 547 |