| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Ébner Dávid (2012)Darnyi Tamás SC | 38.05R:0.57 | - | 241 | |
| 2 | 5 | Kóczi Ezra Sámuel (2012)BVSC-Zugló | 39.70R:0.76 | 01.65 | 213 | |
| 3 | 3 | Gál Levente András (2012)BVSC-Zugló | 39.97R:0.71 | 01.92 | 208 | |
| 4 | 7 | Sallai Áron (2012)H2O Sportegyesület | 40.76 | 02.71 | 196 | |
| 5 | 2 | Dudás Vilmos (2013)Érdi Vízisport Kft | 41.25 | 03.20 | 189 | |
| 6 | 1 | Csernák Soma (2012)Egri Úszó Klub | 41.69 | 03.64 | 183 | |
| 7 | 6 | Tófalvi Balázs Nándor (2013)Kőbánya Sport Club | 41.97R:0.84 | 03.92 | 180 | |
| 8 | 8 | Alexandru Sebastián (2013)FTC | 42.34R:0.67 | 04.29 | 175 |