| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Antal Dávid (2008)Bátori Sárkány ÚE | 24.85 | - | 719 | |
| 2 | 5 | Petróczki Zsombor (2008)Békéscsabai EUK | 26.51 | 01.66 | 592 | |
| 3 | 3 | Buda Levente (2008)UNI Győri Úszó Sportegy. | 26.60 | 01.75 | 586 | |
| 4 | 2 | Spisák Bence (2008)Budaörsi Sport Club | 26.92 | 02.07 | 566 | |
| 5 | 6 | Doszpoly Zsombor (2008)Miskolci Sportiskola | 26.95 | 02.10 | 564 | |
| 6 | 8 | Biben Botond (2009)BVSC-Zugló | 27.38 | 02.53 | 538 | |
| 7 | 1 | Eitler Péter Patrik (2008)Debreceni Sportc. SI | 27.66 | 02.81 | 521 | |
| 8 | 7 | Törő Ármin (2009)Budapesti Honvéd SE | 27.87 | 03.02 | 510 |