| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3 | Takács Nimród (2007)A Jövő SC | 29.09 | - | 448 | |
| 2 | 8 | Nemes Ármin Boldizsár (2009)Kőbánya Sport Club | 29.15 | 00.06 | 445 | |
| 3 | 5 | Medvei Barnabás (2006)Váci Vízmű SE | 29.48 | 00.39 | 431 | |
| 4 | 6 | Pásztor Hunor (2008)Miskolci Sportiskola | 29.69 | 00.60 | 422 | |
| 5 | 1 | Pham Minh Vu (2008)Vietnam | 29.85 | 00.76 | 415 | |
| 6 | 4 | Fábián Gergő (2007)FTC | 30.30 | 01.21 | 397 | |
| 7 | 7 | Kádár Bendegúz (2009)TVSE | 30.74 | 01.65 | 380 | |
| - | 2 | Szaka Szabolcs (2009)Dombóvári | DNS |