| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Orentsák Lóránt (2012)Bohóchal Egyesület | 38.41 | - | 308 | |
| 2 | 6 | Borisov Mikhail (2012)BVSC-Zugló | 40.86 | 02.45 | 256 | |
| 3 | 3 | Hajós Dániel (2012)II. Kerületi Sport | 40.94 | 02.53 | 254 | |
| 4 | 5 | Platonov Iván (2012)Győri Úszó Sportegy. | 41.49 | 03.08 | 244 | |
| 5 | 7 | Jancsa Hetény (2012)Budapesti Honvéd | 41.60 | 03.19 | 242 | |
| 6 | 2 | Hegede Balázs Soma (2012)Iron Swim SE | 42.91 | 04.50 | 221 | |
| 7 | 8 | Szentpéteri Olivér (2013)H2O Sportegyesület | 44.91 | 06.50 | 192 | |
| 8 | 1 | Kuna Márk Károly (2013)BVSC-Zugló | 45.44 | 07.03 | 186 |