| RK | Name | H/L | Time | Gap | Q |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Adorján Kende (2006)Szegedi Úszó Egylet | 01:05.78 | - | A4 | |
| 2 | Herman Szabó Péter (2007)Győri Úszó Sportegy. | 01:06.62 | 00.84 | A5 | |
| 3 | Gasparics Zalán (2007)Érdi Vízisport Kft | 01:08.12 | 02.34 | A3 | |
| 4 | Erdélyi Gergely (2006)Egri Úszó Klub | 01:08.57 | 02.79 | A6 | |
| 5 | Barkóczi Roland (2006)NYSC | 01:08.83 | 03.05 | A2 | |
| 6 | Börzsei Zalán (2007)Soproni Széchy T. SI | 01:08.84 | 03.06 | A7 | |
| 7 | Szatmári Máté (2007)HÓD Úszó SE | 01:09.15 | 03.37 | A1 | |
| 8 | Tóth Gergely Attila (2007)Budaörsi Sport Club | 01:09.38 | 03.60 | A8 | |
| 9 | Varga Marcell (2007)Budapesti Honvéd | 01:09.67 | 03.89 | B4 | |
| 10 | Kocsis Csaba (2006)Debreceni Sportc. SI | 01:09.83 | 04.05 | B5 | |
| 11 | Dominiák Marcell (2007)BVSC-Zugló | 01:10.41 | 04.63 | B3 | |
| 12 | Pittlik Zsigmond (2008)Darnyi Tamás SC | 01:10.52 | 04.74 | B6 | |
| 13 | Farkas Sándor (2006)BVSC-Zugló | 01:10.71 | 04.93 | B2 | |
| 14 | Gulyás Csaba (2007)Parafa Úszó Klub | 01:11.40 | 05.62 | B7 | |
| 15 | Tóth Marcell (2007)Árpád SE | 01:11.53 | 05.75 | B1 | |
| 16 | Juhász Milán (2007)Móri Úszó Egyesület | 01:11.61 | 05.83 | B8 | |
| 17 | Salamon Csanád (2007)Mohácsi Torna Egylet | 01:11.86 | 06.08 | T1 | |
| 18 | Huszár László (2007)FTC | 01:11.90 | 06.12 | T2 | |
| 19 | Kocsis Ádám (2009)Mohácsi Torna Egylet | 01:12.07 | 06.29 | ||
| 20 | Dér Máté (2007)Békéscsaba Előre Úsz | 01:12.11 | 06.33 | ||
| 21 | Buda Levente (2008)Győri Úszó Sportegy. | 01:12.30 | 06.52 | ||
| 22 | Patakfalvi Áron (2007)Kaposvári SI | 01:12.73 | 06.95 | ||
| 23 | Szalay Toshimi (2006)Iron Swim SE | 01:13.21 | 07.43 | ||
| 24 | Kárpáti Kende (2007)Miskolci Sportiskola | 01:13.31 | 07.53 | ||
| 25 | Szeredi Bence (2008)Kőbánya Sport Club | 01:13.45 | 07.67 | ||
| 26 | Kovács Bence Péter (2006)Pécsi Sport Nonprof. | 01:13.95 | 08.17 | ||
| 27 | Szabó Gergő (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 01:14.15 | 08.37 | ||
| 28 | Bóta Depinyi Soma (2006)Lőrinc Swim Team | 01:14.55 | 08.77 | ||
| 29 | Kecse Bence (2006)FTC | 01:14.70 | 08.92 | ||
| 30 | Tóth Dániel (2007)Iron Swim SE | 01:14.81 | 09.03 | ||
| 31 | Spisák Bence (2008)Budaörsi Sport Club | 01:14.82 | 09.04 | ||
| 32 | Rajcsányi Boldizsár (2007)Lőrinc Swim Team | 01:14.95 | 09.17 | ||
| 33 | Kurucz Bendegúz (2007)FTC | 01:14.96 | 09.18 | ||
| 34 | Benke Ádám (2007)Bálinti Úszó Egyes. | 01:15.09 | 09.31 | ||
| 35 | Halmos Máté (2008)Bálinti Úszó Egyes. | 01:15.16 | 09.38 | ||
| 35 | László Dávid (2007)Kiskunhalasi ÚGYE | 01:15.16 | 09.38 | ||
| 37 | König Ábel (2007)Mohácsi Torna Egylet | 01:15.39 | 09.61 | ||
| 38 | Sárosi Csongor (2007)Darnyi Tamás SC | 01:15.45 | 09.67 | ||
| 39 | Varga Benedek (2006)Móri Úszó Egyesület | 01:15.46 | 09.68 | ||
| 40 | Bobola Balázs (2007)Budafóka XXII. SE | 01:15.90 | 10.12 | ||
| 41 | Kanfi-Horváth Levente (2006)HÓD Úszó SE | 01:15.96 | 10.18 | ||
| 41 | Szentmihályi Ábel (2006)Ybl Waterpolo Club | 01:15.96 | 10.18 | ||
| 43 | Orovecz Krisztián (2008)Debreceni Sportc. SI | 01:16.28 | 10.50 | ||
| 43 | Solymosi Gábor (2006)NICS-HSUVC | 01:16.28 | 10.50 | ||
| 45 | Ferecskó Máté (2006)Lenti Gyógyfürdő ÚK | 01:16.33 | 10.55 | ||
| 46 | Rhone Ivan (2006)Pécsi Vörös MeteorSK | 01:16.34 | 10.56 | ||
| 47 | Gulyás Levente (2006)KÚKSE | 01:18.27 | 12.49 | ||
| 48 | Takács Nimród (2007)A Jövő SC | 01:19.12 | 13.34 | ||
| 49 | Csaba György (2008)BVSC-Zugló | 01:20.02 | 14.24 | ||
| - | Baumann Marcell (2006)Győri Úszó Sportegy. | DSQ | |||
| - | Molnár Márk (2006)Szombathelyi SK SI | DSQ | |||