| RK | Name | H/L | Time | Gap | Q |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Zanyi Ferdinánd Tamás (2007)Lőrinc Swim Team | 04:39.56 98.071% | - | D4 | |
| 2 | Kovács Botond (2007)BVSC-Zugló | 04:40.44 95.829% | 00.88 | D5 | |
| 3 | Kárpáti Máté (2008)Újpesti Torna Egylet | 04:41.85 100.802% | 02.29 | D3 | |
| 4 | Buda Levente (2008)Győri Úszó Sportegy. | 04:43.13 98.650% | 03.57 | D6 | |
| 5 | Rajcsányi Boldizsár (2007)Lőrinc Swim Team | 04:45.24 101.175% | 05.68 | D2 | |
| 6 | Varga Levente (2008)Vasas Sport Club | 04:46.72 100.858% | 07.16 | D7 | |
| 7 | Grandpierre Krisztián (2007)FTC | 04:47.05 100.685% | 07.49 | D1 | |
| 8 | Járomi Benjamin (2007)Városi Sportegyesület Dunakeszi | 04:48.12 99.096% | 08.56 | D8 | |
| 9 | Koroncai Mátyás (2008)BVSC-Zugló | 04:49.27 101.902% | 09.71 | T1 | |
| 10 | Pittlik Zsigmond (2008)Darnyi Tamás SC | 04:49.93 97.880% | 10.37 | T2 | |
| 11 | Spisák Bence (2008)Budaörsi Sport Club | 04:51.20 100.787% | 11.64 | ||
| 12 | Nemes Ármin Boldizsár (2009)Kőbánya Sport Club | 04:51.88 98.737% | 12.32 | ||
| 13 | Honti-Pecora Sebestyén (2007)Darnyi Tamás SC | 04:52.62 98.410% | 13.06 | ||
| 14 | Vörös Zsombor (2007)Győri Úszó Sportegy. | 04:53.14 99.754% | 13.58 | ||
| 15 | Szentesi Botond (2008)BVSC-Zugló | 04:53.22 102.325% | 13.66 | ||
| 16 | Tóth Olivér (2007)Újpesti Torna Egylet | 04:53.32 99.489% | 13.76 | ||
| 17 | Bor Tamás László (2008)DKSE Dunaújváros | 04:53.79 100.726% | 14.23 | ||
| 18 | Páva Olivér (2008)A Jövő SC | 04:53.81 100.268% | 14.25 | ||
| 19 | Szabó Marcell Attila (2010)NICS-HSÚVC | 04:54.36 101.334% | 14.80 | ||
| 20 | Szabó Gergő (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 04:54.84 99.172% | 15.28 | ||
| 21 | Huszti Márton (2009)Darnyi Tamás SC | 04:55.70 99.151% | 16.14 | ||
| 22 | Szabó-Kiss Zétény (2007)Móri Úszó Egyesület | 04:55.72 98.830% | 16.16 | ||
| 23 | Nagy Bence (2007)Magnetic Úszó Sport | 04:55.83 98.011% | 16.27 | ||
| 24 | Szavéri Márk (2008)Kőbánya Sport Club | 04:56.43 99.675% | 16.87 | ||
| 25 | Gajdics Balázs (2008)Újpesti Torna Egylet | 04:58.37 103.199% | 18.81 | ||
| 26 | Koch Ambrus (2008)Soproni Széchy T. SI | 04:58.40 99.751% | 18.84 | ||
| 27 | Kurucz Péter (2008)DKSE Dunaújváros | 04:59.19 102.986% | 19.63 | ||
| 28 | Markovics Benedek (2007)DKSE Dunaújváros | 04:59.71 99.973% | 20.15 | ||
| 29 | Nagy-Benedek Olivér (2008)Békéscsaba Előre Úsz | 05:00.05 99.977% | 20.49 | ||
| 30 | Rácz Benedek György (2008)FTC | 05:01.08 99.834% | 21.52 | ||
| 31 | Buzás Bálint Bende (2009)NICS-HSÚVC | 05:03.02 100.698% | 23.46 | ||
| 32 | Pintér Levente (2009)Bohóchal Egyesület | 05:04.08 100.857% | 24.52 | ||
| 33 | Szedlák Csanád Bátor (2008)Darnyi Tamás SC | 05:06.52 101.036% | 26.96 | ||
| 34 | Fekete-Nagy Ábel (2010)Érdi Vízisport Kft | 05:08.32 99.341% | 28.76 | ||
| 35 | Chenhao Yao (2008)Ybl Waterpolo Club | 05:12.95 100.382% | 33.39 | ||
| 36 | Eszenyi Mór (2007)Balaton ÚK Veszprém | 05:18.67 95.150% | 39.11 | ||
| - | Csurgó Tamás (2009)Érdi Vízisport Kft | DSQ - | |||
| - | Orbán Soma (2009)Érdi Vízisport Kft | DSQ - | |||
| - | Pásztor Hunor (2008)Miskolci Sportiskola | DNS - | |||
| - | Sudár Norbert (2009)Újpesti Torna Egylet | DNS - | |||
| - | Varga István János (2009)Darnyi Tamás SC | DNS - | |||