| RK | Name | H/L | Time | Gap | Q |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Pápai Olivér (2009)UNI Győri Úszó Sportegy. | 04:02.41 99.893% | - | D4 | |
| 2 | Kárpáti Máté (2008)Újpesti Torna Egylet | 04:06.66 97.651% | 04.25 | D5 | |
| 3 | Kreisz Bálint (2009)Bohóchal Egyesület | 04:07.36 98.481% | 04.95 | D3 | |
| 4 | Varga Levente (2008)Vasas Sport Club | 04:09.72 98.289% | 07.31 | D6 | |
| 5 | Páva Olivér (2008)A Jövő SC | 04:10.87 100.677% | 08.46 | D2 | |
| 6 | Kakuk Koppány Zéta (2008)Kaposvári Sportközpont és Sportiskola | 04:10.98 94.400% | 08.57 | D7 | |
| 7 | Buda Levente (2008)UNI Győri Úszó Sportegy. | 04:11.82 96.816% | 09.41 | D1 | |
| 8 | Varga István János (2009)Darnyi Tamás SC | 04:12.08 99.369% | 09.67 | D8 | |
| 9 | Szentesi Botond (2008)BVSC-Zugló | 04:13.37 100.299% | 10.96 | T1 | |
| 10 | Bor Tamás László (2008)Dunaújvárosi Központi Sportegyesület | 04:13.42 99.564% | 11.01 | T2 | |
| 11 | Szabó Domonkos (2010)Budafóka XXII. SE | 04:15.71 101.722% | 13.30 | ||
| 12 | Ozsvárt Gábor (2009)Parafa Úszó Klub | 04:15.93 100.532% | 13.52 | ||
| 13 | Sudár Norbert (2009)Újpesti Torna Egylet | 04:16.27 99.836% | 13.86 | ||
| 14 | Lévai Máté (2009)Kőbánya Sport Club | 04:17.61 102.906% | 15.20 | ||
| 15 | Zach Mathew Rodriguez (2009)Vasas Sport Club | 04:23.25 100.386% | 20.84 | ||
| 16 | Steinicz Zalán (2009)Budafóka XXII. SE | 04:23.52 102.266% | 21.11 | ||
| 17 | Hudácskó András (2009)Ferencvárosi Torna Club | 04:23.64 100.988% | 21.23 | ||
| 18 | Kádár Lőrinc (2008)Soproni Széchy T. SI | 04:23.79 100.998% | 21.38 | ||
| 19 | Osztényi Dániel (2008)BÁCSVÍZ KVSC | 04:24.14 102.423% | 21.73 | ||
| 20 | Csiki Brúnó Domonkos (2008)Ybl Waterpolo Club | 04:24.26 99.951% | 21.85 | ||
| 21 | Szánti Gergely (2008)Hullám 91 Úszó és Vízilabda Egyesület | 04:26.23 101.103% | 23.82 | ||
| 22 | Szedlák Csanád Bátor (2008)Darnyi Tamás SC | 04:27.91 100.568% | 25.50 | ||
| 23 | Nahalka Bence (2009)Egri Úszó Klub SE | 04:28.21 100.993% | 25.80 | ||
| 24 | Csurgó Tamás (2009)Érdi Vízisport Kft | 04:28.76 100.393% | 26.35 | ||
| 25 | Araczki-Szabó Olivér (2009)Debreceni Sportc. SI | 04:30.31 100.347% | 27.90 | ||
| 26 | Mátékovits Áron Máté (2008)Monori Sport Egyes. | 04:31.81 100.158% | 29.40 | ||
| 27 | Szabó Gergő (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 04:32.02 100.246% | 29.61 | ||
| 28 | Réthy Balázs (2008)Budapesti Honvéd Sportegyesület | 04:34.11 98.815% | 31.70 | ||
| 29 | Varga Zoltán (2009)Hód Úszó SE | 04:34.55 99.443% | 32.14 | ||
| - | Schönek Lukács (2009)Újpesti Torna Egylet | VL - | VL | ||
| - | Nagy Szabolcs (2009)Békéscsabai Előre Úszó Klub | DNS - | |||
| - | Nagy-Benedek Olivér (2008)Békéscsabai Előre Úszó Klub | DNS - | |||