| RK | Name | H/L | Time | Gap | Q |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Holló Balázs (1999)Egri Úszó Klub | 03:46.23 96.727% | - | D4 | |
| 2 | Mészáros Dániel (2004)FTC | 03:46.72 101.802% | 00.49 | D5 | |
| 3 | Rasovszky Kristóf (1997)Balaton ÚK Veszprém | 03:47.50 99.261% | 01.27 | D3 | |
| 4 | Betlehem Dávid (2003)Balaton ÚK Veszprém | 03:48.01 102.747% | 01.78 | D6 | |
| 5 | Zombori Gábor (2002)Budafóka XXII. SE | 03:48.02 98.504% | 01.79 | D2 | |
| 6 | Flück Barnabás (2003)A Jövő SC | 03:48.96 104.588% | 02.73 | D7 | |
| 7 | Kovacsics Márk (2002)Újpesti Torna Egylet | 03:48.98 102.241% | 02.75 | D1 | |
| 8 | Török Dominik Márk (2002)FTC | 03:50.29 101.269% | 04.06 | D8 | |
| 9 | Kalmár Ákos (2000)Balaton ÚK Veszprém | 03:50.96 97.832% | 04.73 | T1 | |
| 10 | Hartmann Máté (2005)Pécsi Sport Nonprof. | 03:51.39 103.960% | 05.16 | T2 | |
| 11 | Kovács Attila (2004)Egri Úszó Klub | 03:51.61 100.112% | 05.38 | ||
| 12 | Sárkány Zalán (2003)Kőbánya Sport Club | 03:52.18 101.527% | 05.95 | ||
| 13 | Tabi Zoltán (2002)FTC | 03:52.74 102.562% | 06.51 | ||
| 14 | Pintér Ádám (2004)Balaton ÚK Veszprém | 03:54.74 102.577% | 08.51 | ||
| 15 | Povarnitsyn Alexandr (2004)BVSC-Zugló | 03:56.78 100.228% | 10.55 | ||
| 16 | Lengyeltóti Bence (2001)Kaposvári "Adorján" | 03:57.10 99.839% | 10.87 | ||
| 17 | Szedlák Gellért (2004)Darnyi Tamás SC | 03:57.93 102.711% | 11.70 | ||
| 18 | Tohl Patrik Péter (2004)Érdi Vízisport Kft | 03:58.09 102.697% | 11.86 | ||
| 19 | Nagy Dániel (2003)Darnyi Tamás SC | 03:58.39 98.777% | 12.16 | ||
| 20 | Miló-Sidló Marcell (2003)BVSC-Zugló | 03:58.66 100.263% | 12.43 | ||
| 21 | Demjén Bátor (2003)BÁCSVÍZ SC | 04:00.68 102.278% | 14.45 | ||
| 22 | Kennedy Valér Huba (2005)Győri Úszó Sportegy. | 04:00.76 104.928% | 14.53 | ||
| 23 | Horváth Ákos (2006)HÓD Úszó SE | 04:01.19 99.780% | 14.96 | ||
| 24 | Kaiser Dominik (2007)Bajai SSC | 04:02.04 103.616% | 15.81 | ||
| 25 | Duca Stefan-Mirceh (2006)Egri Úszó Klub | 04:02.16 100.758% | 15.93 | ||
| 26 | Tóth Benedek Viktor (2006)Kőbánya Sport Club | 04:02.82 104.247% | 16.59 | ||
| 27 | Ozsvárt Bence (2005)Parafa Úszó Klub | 04:04.68 101.199% | 18.45 | ||
| 28 | Kovács-Seres Hunor (2006)DKSE Dunaújváros | 04:04.82 97.561% | 18.59 | ||
| 29 | Tohl Dániel Antal (2005)Érdi Vízisport Kft | 04:06.47 102.074% | 20.24 | ||
| 30 | Nagy Márton (2004)Darnyi Tamás SC | 04:06.52 103.291% | 20.29 | ||
| 31 | Hegedűs Kristóf (2004)DKSE Dunaújváros | 04:08.09 101.297% | 21.86 | ||
| 32 | Pigler Attila (2003)Érdi Vízisport Kft | 04:08.81 100.020% | 22.58 | ||
| 33 | Krupánszki Erik (2004)Bálinti Úszó Egyes. | 04:17.24 98.931% | 31.01 | ||
| - | Gálicz László (2004)FTC | DNS - | |||
| - | Hambardzumyan Arshak (2004)Újpesti Torna Egylet | DNS - | |||
| - | Kakuk Koppány (2008)Kaposvári SI | DNS - | |||
| - | Milák Kristóf (2000)Budapesti Honvéd | DNS - | |||
| - | Sárosi Balázs (2004)Debreceni Sportc. SI | DNS - | |||
| - | Versitz Ákos (2004)FTC | DNS - | |||