| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | M.Kiss Mózes (2013)Bohóchal Egyesület | 39.96R:0.7 | - | 208 | |
| 2 | 0 | Pártos Zsombor (2012)Bálinti Úszó Egyes. | 41.34R:0.52 | 01.38 | 188 | |
| 3 | 2 | Pintér Vincent (2012)FTC | 41.45R:0.55 | 01.49 | 187 | |
| 4 | 1 | Prokopy Endre Rudolf (2011)Bálinti Úszó Egyes. | 42.15R:0.56 | 02.19 | 177 | |
| 5 | 4 | Dobján Krisztián (2013)DELFIN SE | 42.26R:0.48 | 02.30 | 176 | |
| 6 | 6 | Máté Korvin Antal (2013)Budafóka XXII. SE | 43.38R:0.64 | 03.42 | 163 | |
| 7 | 7 | Bartolák Botond (2013)Monori Sport Egyes. | 44.54R:0.61 | 04.58 | 150 | |
| 8 | 3 | Ebinger Zsombor (2015)Kőbánya Sport Club | 44.89R:0.67 | 04.93 | 147 | |
| 9 | 8 | Horváth Márk (2013)Bálinti Úszó Egyes. | 45.40R:0.79 | 05.44 | 142 | |
| 10 | 9 | Barta Ákos (2013)Budapesti Honvéd | 45.52R:0.68 | 05.56 | 141 |