| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Balog Dávid (2014)Pécsi Sportiskola | 38.37R:0.58 | - | 161 | |
| 2 | 7 | Jónás Benedek (2014)Keszthelyi Kiscápák | 41.97 | 03.60 | 123 | |
| 3 | 6 | Polgár Szigfrid (2014)Zalaco ZÚK | 43.55R:0.69 | 05.18 | 110 | |
| 4 | 0 | Ruzsa Marcell (2016)Mohácsi Torna Egylet | 44.46R:0.52 | 06.09 | 104 | |
| 5 | 1 | Vacsi Botond (2016)Kaposvári Úszó SE | 46.41R:0.68 | 08.04 | 91 | |
| 6 | 2 | Dezső Albert Attila (2016)Keszthelyi Kiscápák | 47.57 | 09.20 | 84 | |
| - | 5 | Matias Tristan (2015)Zalaco ZÚK | DNS | |||
| - | 3 | Bognár Maxx Axel (2016)Mohácsi Torna Egylet | DSQ | |||
| - | 8 | Csikó Dávid (2016)Zalaco ZÚK | DSQ | |||
| - | 9 | Rhone Richard (2009)PVM SK | DNS |