| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Fehérvári Edvárd (2008)Százhalombattai VUKSE | 00:26.02 | - | 626 | |
| 2 | 8 | Hartmann Máté (2005)Pécsi Sportiskola | 00:26.29 | 00:00.27 | 607 | |
| 3 | 5 | Németh Kolos (2008)Pécsi Sportiskola | 00:26.78 | 00:00.76 | 575 | |
| 4 | 3 | Mátyás Martin (2009)Pécsi Sportiskola | 00:27.27 | 00:01.25 | 544 | |
| 5 | 6 | Magyar Péter József (2010)Pécsi Sportiskola | 00:27.31 | 00:01.29 | 542 | |
| 6 | 1 | Vörös Zétény Zoltán (2011)FTC | 00:27.39 | 00:01.37 | 537 | |
| 7 | 7 | Szabó-Kiss Zétény (2007)Móri Úszó Egyesület | 00:27.68 | 00:01.66 | 520 | |
| 8 | 2 | Major-Varga Trisztán (2008)Pécsi Sportiskola | 00:27.90 | 00:01.88 | 508 | |
| 9 | 0 | Maruzs Bence (2009)Budapesti Honvéd SE | 00:28.19 | 00:02.17 | 493 | |
| 10 | 9 | Magda Mirkó (2008)Móri Úszó Egyesület | 00:28.63 | 00:02.61 | 470 |