| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | Pusztai Dániel (2013)Iron Swim SE | 48.08R:0.69 | - | 157 | |
| 2 | 7 | Császár-Bíró Máté (2013)Kőbánya Sport Club | 48.25R:0.81 | 00.17 | 155 | |
| 3 | 6 | Vesztergom Dániel (2014)Darnyi Tamás SC | 56.23R:0.52 | 08.15 | 98 | |
| 4 | 3 | Blendea Péter (2013)Csepeli Öttusa Vizis | 01:01.84R:0.85 | 13.76 | 73 | |
| 5 | 4 | Szavéri Patrik (2015)Kőbánya Sport Club | 01:02.37R:0.99 | 14.29 | 72 | |
| 6 | 5 | Tubak-Csörnyei Máté (2016)Tiszakécskei Vízis | 01:07.73R:0.34 | 19.65 | 56 |