| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3 | Bukovics Bendegúz Alex (2013)Budapesti Honvéd | 50.45R:0.68 | - | 136 | |
| 2 | 4 | Dmitrenko Nikita (2015)Bohóchal Egyesület | 51.29R:0.98 | 00.84 | 129 | |
| 3 | 5 | Barta Ákos (2013)Budapesti Honvéd | 52.79R:0.91 | 02.34 | 118 | |
| 4 | 2 | Szilágyi Dániel (2013)Budapesti Honvéd | 52.89R:0.78 | 02.44 | 118 | |
| 5 | 7 | Juhász Vince (2013)Érdi Vízisport Kft | 53.56R:0.86 | 03.11 | 113 | |
| 6 | 1 | Csajági Dániel (2014)Iron Swim SE | 53.59R:0.58 | 03.14 | 113 | |
| 7 | 8 | Dobák Milán Kolen (2014)A Jövő SC | 54.14R:0.64 | 03.69 | 110 | |
| 8 | 0 | Fehér Illés (2015)Gigászok SE | 56.99R:0.77 | 06.54 | 94 | |
| 9 | 9 | Urbán Mirkó (2015)Ferencvárosi Torna Club | 58.05 | 07.60 | 89 | |
| - | 6 | Ecker Ákos (2012)Tatabányai Vizmü SE | VL |