| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Csikós Mátyás (2015)Szombathelyi SK SI | 41.71 | - | 125 | |
| 2 | 4 | Szeitner Szabolcs Nimród (2014) UNI Győri Úszó Sportegy. | 42.39 | 00.68 | 120 | |
| 3 | 6 | Lehotay Andor (2015)Szombathelyi SK SI | 45.49 | 03.78 | 97 | |
| 4 | 0 | Végh Máté (2016) UNI Győri Úszó Sportegy. | 45.51 | 03.80 | 96 | |
| 5 | 3 | Végh Zétény (2015)Keszthelyi Kiscápák | 46.37 | 04.66 | 91 | |
| 6 | 8 | Rédeky Bence (2015)Keszthelyi Kiscápák | 50.54 | 08.83 | 70 | |
| 7 | 9 | Pirger Atilla (2016)Soproni Széchy T. SI | 50.55 | 08.84 | 70 | |
| - | 2 | Jónás Benedek (2014)Keszthelyi Kiscápák | DNS | |||
| - | 7 | Jónás Bertalan (2016)Keszthelyi Kiscápák | DNS | |||
| - | 1 | Dezső Albert Attila (2016)Keszthelyi Kiscápák | DNS |