| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 6 | Drízner Tamás (2011)Debreceni Sportc. SI | 45.08 | - | 190 | |
| 2 | 5 | Piros Kristóf (2015)Debreceni Sportc. SI | 45.58 | 00.50 | 184 | |
| 3 | 4 | Milotai Milán (2013)Létavértes | 46.28 | 01.20 | 176 | |
| 4 | 3 | Holecskó Dominik (2011)Létavértes | 46.82R:0.75 | 01.74 | 170 | |
| 5 | 7 | Tóth Miklós (2011)Ibrányi Úszó Sporteg | 48.58R:0.46 | 03.50 | 152 | |
| 6 | 1 | Lesku Barnabás (2010)NYSC | 49.65R:0.9 | 04.57 | 142 | |
| 7 | 8 | Kovács Kálmán Kristóf (2014)Debreceni Sportc. SI | 50.12 | 05.04 | 138 | |
| 8 | 0 | Végh Tamás (2015)Debreceni Sportc. SI | 52.40 | 07.32 | 121 | |
| 9 | 9 | Borbély Zalán (2015)Crisul Oradea | 55.06 | 09.98 | 104 | |
| - | 2 | Ivicz Kristóf (2013)Egri Úszó Klub SE | DNS |