| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Nehiba Dominik (2016)UNI Győri Úszó Sportegy. | 00:43.15 | - | 217 | |
| 2 | 5 | Nagy Noé Bálint (2015)KORALL Úszó Egyesüle | 00:43.27 | 00:00.12 | 215 | |
| 3 | 3 | Varga Márton (2015)Kaposvári Sportközpont és Sportiskola | 00:43.67 | 00:00.52 | 209 | |
| 4 | 6 | Győri Ádám István (2015)Balaton ÚK Veszprém | 00:44.58 | 00:01.43 | 197 | |
| 5 | 2 | Varga-Futó Dávid (2016)Tatabányai Vizmü SE | 00:44.86 | 00:01.71 | 193 | |
| 6 | 7 | Varga Bence (2015)Soproni Széchy T. SI | 00:46.24 | 00:03.09 | 176 | |
| 7 | 8 | Bognár Maxx Axel (2016)Mohácsi Torna Egylet | 00:47.47 | 00:04.32 | 163 | |
| 8 | 1 | Alotti Gaál Emir (2015)Szombathelyi SK SI | 00:48.10 | 00:04.95 | 157 | |
| 9 | 0 | Lakatos Kristóf (2015)Soproni Széchy T. SI | 00:48.57 | 00:05.42 | 152 | |
| 10 | 9 | Elmauer Ábel Márk (2015)Dombóvári Sportiskola Egyesület | 00:52.53 | 00:09.38 | 120 |