| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Urbán Anna Gréta (2013)A Jövő SC | 45.90R:0.7 | - | 200 | |
| 2 | 6 | Skotner Ágota (2014)Budaörsi Sport Club | 46.30R:0.53 | 00.40 | 195 | |
| 3 | 3 | Horváth Zoé (2014)Tatabányai Vizmü SE | 47.11 | 01.21 | 185 | |
| 4 | 4 | Ledniczky Panka Zoé (2015)Tatabányai Vizmü SE | 47.64R:0.7 | 01.74 | 179 | |
| 5 | 8 | Balla Bíborka Csenge (2013)Szhalombattai VUK SE | 48.19R:0.8 | 02.29 | 173 | |
| 6 | 2 | Vígh Viktória Csenge (2013)Tatabányai Vizmü SE | 48.75R:-0.24 | 02.85 | 167 | |
| 7 | 9 | Karzazi Lilya (2015)Budapesti Honvéd | 49.72R:0.66 | 03.82 | 157 | |
| 8 | 1 | Nagy Bianka (2014)Tatabányai Vizmü SE | 50.71R:0.66 | 04.81 | 148 | |
| 9 | 0 | Nyisztor Sarolt (2016)Tatabányai Vizmü SE | 53.56R:0.55 | 07.66 | 126 | |
| - | 7 | Szobi Emma (2016)Tatabányai Vizmü SE | VL |