| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Istella Ákos (2016)Kalocsai Úszó és Vízilabda Egyesület | 43.91 | - | 107 | |
| 2 | 6 | Vendlóczki Károly Richárd (2016)Four Diamonds SE | 47.58 | 03.67 | 84 | |
| 3 | 1 | Soós László András (2014)Hód Úszó SE | 47.78 | 03.87 | 83 | |
| 4 | 3 | Jani Botond (2016)Makói Úszó Klub | 49.25 | 05.34 | 76 | |
| 5 | 0 | Kovács Péter (2015)Békéscsabai EUK | 49.33 | 05.42 | 76 | |
| 6 | 4 | Fazekas Vince (2015)Four Diamonds SE | 49.64 | 05.73 | 74 | |
| 7 | 8 | Teodorovic Bátor Zalán (2016)Hód Úszó SE | 53.45 | 09.54 | 59 | |
| 8 | 9 | Tubak-Csörnyei Máté (2016)Tiszakécskei Vízis | 54.55 | 10.64 | 56 | |
| - | 7 | Zimbran Benjamin (2015)Murry San Arad SC | DNS | |||
| - | 2 | Rus Tudor (2015)Murry San Arad SC | DNS |