| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Petrovics Róbert (2012)Hatvani Úszó Klub SE | 39.21 | - | 216 | |
| 2 | 5 | Medgyaszay Miklós (2014)Soproni Széchy T. SI | 40.22 | 01.01 | 200 | |
| 3 | 3 | Hürkecz Gergő (2012)FTC | 40.74 | 01.53 | 193 | |
| 4 | 6 | Nagy-Hegedűs Ábel (2012)Hullám 91 | 40.81 | 01.60 | 192 | |
| 5 | 7 | Szilágyi Ádám (2015)Szombathelyi SK SI | 42.68 | 03.47 | 167 | |
| 6 | 2 | Horváth Benedek (2014)Szombathelyi SK SI | 43.31 | 04.10 | 160 | |
| 7 | 0 | Fülöp Ábel (2014)Szombathelyi SK SI | 43.48 | 04.27 | 158 | |
| 8 | 1 | Solymos Péter (2014)Szombathelyi SK SI | 43.89 | 04.68 | 154 | |
| 9 | 8 | Béres Szabolcs (2013)M-Mekler László SE | 48.10 | 08.89 | 117 | |
| - | 9 | Kiss Zétény (2016)Keszthelyi Kiscápák | DNS |