| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 6 | Szabácsik Máté (2007)Budapesti Honvéd | 01:02.11 | - | 504 | |
| 2 | 4 | Bartalos Gábor (2007)Tatabányai Vizmü SE | 01:02.56 | 00.45 | 493 | |
| 3 | 2 | Hegedűs Marcell (2008)Budapesti Honvéd | 01:03.22 | 01.11 | 478 | |
| 4 | 3 | Takács Nimród (2007)A Jövő SC | 01:03.30 | 01.19 | 476 | |
| 5 | 7 | Szavéri Márk (2008)Kőbánya Sport Club | 01:03.57 | 01.46 | 470 | |
| 6 | 5 | Medvei Barnabás (2006)Váci Vízmű SE | 01:04.43 | 02.32 | 452 | |
| 7 | 8 | Zelenai Zénó (2008)BVSC-Zugló | 01:05.22 | 03.11 | 435 | |
| 8 | 1 | Csillik Béla Milán (2008)BVSC-Zugló | 01:06.17 | 04.06 | 417 |