| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | Hegedűs Levente (2011)Pécsi Sportiskola | 38.93 | - | 296 | |
| 2 | 3 | Konstantinopoulos Márk (2010)MATE - GEAC | 39.89 | 00.96 | 275 | |
| 3 | 4 | Villert Máté (2010)Bálinti Úszó Egyes. | 40.17 | 01.24 | 269 | |
| 4 | 7 | Szira Tamás (2011)MATE - GEAC | 42.63 | 03.70 | 225 | |
| 5 | 2 | Palov Péter (2011)Budapesti Honvéd SE | 44.00 | 05.07 | 205 | |
| 6 | 1 | Stipkovits Tamás (2012)UNI Győri Úszó Sportegy. | 44.85 | 05.92 | 193 | |
| 7 | 8 | Tari Ádám (2011)Parafa Úszó Klub | 46.98 | 08.05 | 168 | |
| - | 6 | Fűr-Kovács Dániel (2009)II. Kerületi Sport | DNS |