| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Kendrella Bence (2010)Békési Úszó Klub E. | 02:31.70 | - | 565 | |
| 2 | 5 | Keresztúri Zsombor (2013)Békéscsabai EUK | 02:57.84 | 00:26.14 | 351 | |
| 3 | 3 | Szálku Marcell (2013)Debreceni Sportc. SI | 03:09.05 | 00:37.35 | 292 | |
| 4 | 6 | Holland Regő (2013)Békési Úszó Klub E. | 03:10.13 | 00:38.43 | 287 | |
| 5 | 1 | Domokos Noel Áron (2014)Békéscsabai EUK | 03:15.13 | 00:43.43 | 265 | |
| 6 | 2 | Kopcsák Dominik (2014)Békéscsabai EUK | 03:15.97 | 00:44.27 | 262 | |
| 7 | 7 | Kovács Krisztián Lajos (2016)Mezőtúri ÚVSE | 03:25.04 | 00:53.34 | 229 | |
| 8 | 8 | Kis Adrián (2014)SZVUK (régi) | 03:28.18 | 00:56.48 | 218 |