| RK | LN | Name | Time | Gap | FINA | Q? |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | Kolesár Jakub (2008)Orca Michalovce Úszóklub | 28.49R:0.61 | - | 564 | |
| 2 | 6 | Koch Ambrus (2008)Soproni Széchy T. SI | 29.55R:0.61 | 01.06 | 506 | |
| 3 | 5 | Molnár-Végh Bálint (2009)Szombathelyi SK SI | 29.62R:0.84 | 01.13 | 502 | |
| 4 | 3 | Tichý Oliver (2008)VŠK FTVŠ UK Lafranconi | 29.82R:0.73 | 01.33 | 492 | |
| 5 | 7 | Péntek Márk László (2008)Sárvári Gyógyfürdő | 30.09R:0.66 | 01.60 | 479 | |
| 6 | 2 | Gadányi Márk (2008)NivoMed Egyesület | 30.23R:0.59 | 01.74 | 472 | |
| 7 | 1 | Hubert Balázs (2008)Budapesti Honvéd SE | 31.17R:0.7 | 02.68 | 431 | |
| 8 | 8 | Csiszár Ákos (2008)KASI | 31.67R:0.66 | 03.18 | 411 | |
| 9 | 0 | Hrina Martin (2008)VŠK FTVŠ UK Lafranconi | 32.09R:0.66 | 03.60 | 395 | |
| 10 | 9 | Lehotay Nándor (2009)Szombathelyi SK SI | 35.29R:0.72 | 06.80 | 297 |